La historia de San José del Valle se remonta al siglo VII, cuando los árabes ocuparon la región. En aquel momento la villa era un asentamiento estratégico de Hisn Tabul.
Posteriormente, a comienzos del siglo XIV los monarcas cristianos conquistaron la ciudad y expulsaron a los árabes. El municipio y el castillo fueron entregados a Jerez y para recuperar la actividad San José del Valle se centró en la industria ganadera.
Los anteriores pobladores de los que descienden los habitantes actuales pertenecían principalmente a órdenes religiosas. En 1695 los Carmelitas Descalzos llegaron a la región y establecieron en ella su lugar de retiro. Construyeron un convento en la pequeña ciudad y así fue aumentando la población. En 1835 los frailes se fueron pero se quedaron los nuevos habitantes.
San José del Valle siguió creciendo a un ritmo constante y en 1908 la orden religiosa de los Salesianos construyó un colegio. Desde los años 50 en adelante San José del Valle prosperó y se desarrolló totalmente como pueblo. Fue declarado oficialmente municipio de la provincia de Cádiz en 1995.
